一、蛋白質編碼基因數量不同 1、X染色體：X染色體上有1098個蛋白質編碼基因。 2、Y染色體：Y染色體包含著約78個編碼蛋白質的基因。 二、結構不同 1、X染色體：X染色體上的基因密度屬於較低的，X染色體的“始祖”基因密度就比較低，當然也有可能是那些需要雙複製、編碼關鍵蛋白質的基因在哺乳動物漫長的進化歷程中已經從X染色體轉移到了其它染色體上，從而保證得到雙複製。 2、Y染色體：Y染色體的迴文結構裡容納了許多基因，由於迴文結構裡的兩段對應序列實際上相同，因此一個基因在迴文結構中就存在兩份複製。這樣，儘管Y染色體沒有配對的染色體可供交換遺傳物質，卻能夠在內部完成一種“基因轉變”過程，對基因變異進行類似的修復。 三、特點不同 1、X染色體：X染色體上的基因缺陷通常反應在男性患者身上，因為Y染色體上缺少可以“彌補”這種缺陷的等位基因。 2、Y染色體：Y染色體內部的基因轉變，發生頻率與一般染色體的基因交換一樣高。從父親到兒子僅一代遺傳中，Y染色體就會有600個鹼基對被重寫。 來源：-Y染色體 來源：-x染色體