兩部相機都是尼康為體育和新聞攝影推出的頂級機身，在高感和對焦效能方面尤其突出。大的方面具體區別如下：D3的ISO（感光度）200-6400，D4的ISO100-12800。當然，都還可以擴充套件兩檔。

D3根本就沒有影片拍攝功能，而D4具有1920*1080，4：2：2，30P高畫質影片拍攝和HDMI輸出。D4還具有通用網線插口。全媒體相機可能由此兩項而來。

D4全畫素JPG的高速連拍是每秒10-11張，具體可以連拍多長時間我還不知道，演示影片中是拍了7秒。D3全畫素時，JPG格式是每秒9張，能連續拍攝大約三秒多一點。D4比D3多了400萬畫素即1600萬。

D4為即時取景拍攝設計的超靜音（寧靜）快門釋放模式，幾乎完全消除了反光鏡和快門操作時的噪音，在音樂會等場合很有用。

雖然都是雙卡槽D3是兩個CF卡槽，D4雙卡槽其中的一個是更高速的XQD卡槽。D4在畫幅裁剪上比D3多了一個1.2倍畫幅。

最後，讓人不爽的是D4的電池容量比D3縮減了500mAh，變成2000mAh，廠方的解釋是日本國內的新法規規定所致。