發粘的、表面都拉絲的金針菇不可再食用，表示以已腐化、腐爛。

辨別金針菇好壞，只需看它的菇帽，如果完全長開或開裂，說明金針菇已經老了或不新鮮了，甚至壞了。金針菇菌蓋嫩滑、營養豐富，儘量挑選新鮮的購買。買時最好挑15釐米左右的，這個長度的質量最好。

需要注意的是，不管是哪種金針菇，顏色都不會特別鮮亮。新鮮金針菇分黃色和白色兩種，黃色金針菇應該是淡黃色或黃褐色的，頂端的“菇帽”中間顏色較深，菇柄顏色上淺下深，而白色金針菇是淡白或乳白色的。

有些不法商家可能會用硫磺熏製等方法先處理一下金針菇（金針菇罐頭），然後再煮熟，讓金針菇美容增白。但如果使用了工業硫磺(有致癌作用)、連二亞硫酸鈉(有強烈刺激作用，會損傷人的眼睛和面板黏膜)等非法新增劑，對健康的損害就很大。

而且，為了延長金針菇的保質期，浸泡金針菇的“營養水”也可能被不法商販做手腳。如果是正常加工生產的金針菇罐頭，浸泡湯汁很清亮，如果湯汁渾濁，雜質也多，建議大家不要購買，很可能添加了不該新增的東西。