這是因為醒來時所處的睡眠階段不同。一個是深度睡眠階段，這時大腦在休息；一個是異相睡眠階段，這時大腦覺醒，處於清醒階段。 睡眠是有周期的，由非快速眼動週期（慢波相）和快速眼動週期（異相睡眠）組成。 非快速眼動週期包括： （1）淺睡期 （2）輕睡期 （3）中睡期 （4）深睡期 長時間午睡醒來腦袋像漿糊，是因為你進入了深睡眠階段，若在此時醒來，就會感到周身不舒服而更加睏倦。這是由於被抑制了的大腦皮層還未解除，關閉的毛細血管還未開放，大腦出現暫時的相對的供血不足，造成一時性植物神經功能紊亂所致。 睡眠時相的轉換 正常成年人入睡後，首先進入慢波相，通常依次為1～2～3～4～3～2等期，歷時70～120分鐘不等，即轉入異相睡眠，約5～15分鐘，這樣便結束第1個時相轉換，接著又開始慢波相，並轉入下一個異相睡眠，如此週而復始地進行下去。整個睡眠過程，一般有4～6次轉換，慢波相時程逐次縮短，並以第2期為主，而異相時程則逐步延長。因而這時醒來腦袋會不會不舒服。