小腸癌的檢查首先是外科體檢，即醫生徒手進行體檢，有的病人會發現腹部腫塊；可以先作腸道X線檢查，如果懷疑十二指腸有病變可作腸造影。實驗室檢查需要做糞便潛血檢查；影像檢查需要做CT磁共振；儀器檢查是腸鏡檢查。

1. 小腸氣鋇雙重造影：檢查時可以觀察整個小腸黏膜形態以便於明確病變部位，對小腸腔內病變與腸壁受累情況下的腫瘤、憩室、狹窄性病變等具有較高的診斷價值。

2. B超：能夠清晰觀察臟器及周圍器官的各種病變，為明確診斷提供依據。還能為腸梗阻、十二指腸腺癌等疾病提供鑑別依據。

3. CT小腸癌模擬內鏡：可較清楚地觀察腹腔內腫瘤形態、浸潤程度及與周圍組織的關係從而確定是否侵犯到周圍血管、遠處臟器、淋巴結。

4. 正電子發射計算機斷層顯像-電子計算機斷層掃描（PET-CT）：透過標誌物來確定腫瘤細胞的代謝活性，評價腫瘤的功能和代謝狀態，此檢查既能發現原發部位的病變，也可瞭解腫瘤的轉移狀況。

5. 膠囊內鏡：該檢查可直接觀察到小腸內部病變情況，對診斷小腸器質性病變具有重要價值。

6. 腹腔鏡：發現不容易發現的腸道病變。