目前發現，造成艾滋病患者機會性感染的病原體約有數十種，如卡氏肺囊蟲、弓形體、新型隱球菌、念珠菌、單純皰疹病毒、鳥型胞內分枝桿菌、鉅細胞病毒、隱孢子蟲和孢子球蟲等等。

當這些病原體存在於正常人體內時，其致病能力是非常低的，故基本上不表現出臨床症狀，但由於艾滋病患者的機體抵抗力已經十分衰弱，感染髮生在其身上時，則表現得異常險惡甚至危及生命。

一名艾滋病患者的機會性感染，可以是多種病原體造成的數種感染，且受感染的器官組織是廣泛的，而且機會頻繁。

臨床上將各種艾滋病患者的機會性感染分成幾種型別：肺型、中樞神經系統型、胃腸型和無名熱型等。

（1）在肺型機會性感染中，以肺孢子蟲肺炎最常見，其感染率平均可高達57%，常是艾滋病患者的致死疾患。

（2）中樞神經系統型機會性感染的症狀多見於中樞神經和末梢神經病變，如痴呆綜合徵、抑鬱症及末梢神經病變等。

（3）胃腸型的艾滋病機會性感染中，以隱孢子蟲病最常見，其次為藍氏賈第鞭毛蟲病，可造成患者慢性消耗性腹瀉。

（4）無名熱型機會性感染則與分枝桿菌的感染關係密切。