豆漿機的內部結構一般有兩種，一是使用最多最普遍的，不鏽鋼內壁，而且是食品級不鏽鋼，俗稱304不鏽鋼的。二是塑膠的，耐高溫120℃無毒的PP材質。

無論是不鏽鋼的還是塑膠的內壁，在用來做米粉糊糊或是豆漿或是雜糧粥，其內壁附著的那一層都不是吸附得特別結實。在清理時一般用水先沖洗一下，剩下的就需要用軟刷或者百潔布輕輕磨蹭一下，然後用水衝乾淨。

如果是邊角部位不容易清潔到的地方，可用乾淨的硬毛牙刷頭刷洗。無論是不鏽鋼還是塑膠內膽，建議避免使用鋼絲球磨蹭，容易造成內壁粗糙，嚴重縮短使用壽命。

清潔時注意避讓鋒利的刀頭，以免傷到手指。清潔完的豆漿機，擦拭內膽乾燥後放置，特別是使用頻次不高的，更要晾乾後再裝起來。

豆漿機做好豆漿後，放置太長的時間內壁幹了以後會很難清洗，所以打過豆漿後，豆漿機下蓋部位要加水清泡以便清洗。

豆漿機使用時間長了會有汙垢，怎麼清洗呢？可以用牙膏清洗：在豆漿機內壁擠上少許牙膏，用溼的洗碗布擦去汙垢，清水洗淨即可。還可以用白醋清洗：豆漿機內加入適量的白醋和水，靜泡一會再擦洗乾淨就可以了。另外用檸檬汁和適量的水浸泡一會，也能去除豆漿機內壁的黃色汙垢。