消毒是指殺滅病原微生物的方法。臨床上根據消毒的目的，可分以下三種情況。 （1）預防性消毒 主要是為預防傳染性疾病的發生，定期地對犬、犬舍、用具、運動場及飲水等進行消毒。 （2）隨時消毒 是指疫病發生期間，為了及時消滅剛從病畜體內排出的病原體而採取的消毒措施。針對的是犬舍、場地、分泌物、排洩物及可能汙染的一切場所、用具、物品，通常在解除封鎖前，進行定期的多次消毒，病畜隔離舍應每天和隨時進行消毒。 （3）終末消毒 在患犬解除隔離、痊癒或死亡後，為了消滅疫區內可能殘留的病原體所進行的全面徹底的大消毒。 消毒的物件是犬及排洩物、分泌物、用具、犬舍、運動場、人員用品等。臨床上常用的方法有物理消毒法、化學消毒法、生物消毒法三大類。物理消毒法主要是針對犬的用具、人員用品及犬舍等消毒，它包括應用紫外滅菌燈、煮沸、高壓蒸汽滅菌等；化學消毒法主要是針對犬舍、用具、運動場、犬、環境等消毒，它是應用化學制劑殺滅病原體的方法；生物消毒法是針對排洩物及分泌物消毒的一種利用微生物的作用殺滅致病菌和蟲卵的方法。