醫學上的治療方法並沒有主流和非主流的區分方法。近些年，由於循證醫學的發展，提出根據流行病學調查，隨機對照雙盲臨床試驗、薈萃分析等科學的方法來評價治療方法的療效、不良反應，同時結合治療方法的經濟性和可獲得性，從而制定各個疾病的治療指南，推薦該疾病的首選治療方法和一、二、三線治療方法。
那麼自閉症的推薦治療方法是以藥物治療、心理治療、康復治療相結合的綜合治療。藥物治療中推薦使用非典型抗精神病藥物對症治療患兒的行為紊亂及衝動暴力。可使用抗抑鬱藥物處理情緒問題。氟哌啶醇可以使患兒安靜下來，可用於興奮吵鬧的患兒。哌甲酯可治療伴有多動症的患兒，亦可使少動的患兒活躍起來。普萘洛爾也可減輕患兒的衝動和攻擊行為。納曲酮可促進患兒交往，減少刻板動作及自傷行為。心理治療中認知行為治療、支援性心理治療、家庭心理治療、行為矯正治療等均能對自閉症疾病的緩解及預後的提高產生積極的作用。而康復治療主要是透過各種教育及訓練的方式刺激患兒的大腦發育，提高患兒的各項能力，如生活自理能力、社會交往能力，職業能力等，使患兒能學習到基本文化知識以及基本技能，提高社會適應能力。各項臨床試驗及回顧性研究以證實上述治療可提高自閉症患者的生活質量，改善疾病的預後。自閉症患者均可在上述治療中獲益。
醫學上的治療方法並沒有主流和非主流的區分方法。近些年，由於循證醫學的發展，提出根據流行病學調查，隨機對照雙盲臨床試驗、薈萃分析等科學的方法來評價治療方法的療效、不良反應，同時結合治療方法的經濟性和可獲得性，從而制定各個疾病的治療指南，推薦該疾病的首選治療方法和一、二、三線治療方法。
那麼自閉症的推薦治療方法是以藥物治療、心理治療、康復治療相結合的綜合治療。藥物治療中推薦使用非典型抗精神病藥物對症治療患兒的行為紊亂及衝動暴力。可使用抗抑鬱藥物處理情緒問題。氟哌啶醇可以使患兒安靜下來，可用於興奮吵鬧的患兒。哌甲酯可治療伴有多動症的患兒，亦可使少動的患兒活躍起來。普萘洛爾也可減輕患兒的衝動和攻擊行為。納曲酮可促進患兒交往，減少刻板動作及自傷行為。心理治療中認知行為治療、支援性心理治療、家庭心理治療、行為矯正治療等均能對自閉症疾病的緩解及預後的提高產生積極的作用。而康復治療主要是透過各種教育及訓練的方式刺激患兒的大腦發育，提高患兒的各項能力，如生活自理能力、社會交往能力，職業能力等，使患兒能學習到基本文化知識以及基本技能，提高社會適應能力。各項臨床試驗及回顧性研究以證實上述治療可提高自閉症患者的生活質量，改善疾病的預後。自閉症患者均可在上述治療中獲益。