1.咽部鄰近的上呼吸道病變如鼻腔、鼻竇、鼻咽部的慢性炎症，可因炎性分泌物經後鼻孔倒流至咽部刺激咽部黏膜；慢性鼻炎、鼻中隔偏曲、慢性鼻竇炎、腺樣體肥大、鼾症或鼻腔鼻竇及鼻咽部佔位性病變等疾病由於影響鼻腔通氣，造成長期張口呼吸，引起咽部黏膜長期過度乾燥而導致慢性咽炎；慢性扁桃體炎的慢性炎症可直接蔓延至咽後壁，引起慢性咽炎；口腔炎症如果不能得到及時控制，隨著炎症擴散也可導致慢性咽炎。

2.氣候及地域環境變化溫度、溼度的變化、空氣質量差、菸酒刺激、辛辣刺激性食物、粉塵、有害氣體及放射性照射也是導致慢性咽炎的原因。

3.職業因素長期大量用聲者如教師、歌唱者及易感體質因素亦可引起本病。

4.全身因素如貧血，消化不良，胃食管反流，心臟病（因血液迴圈障礙影響咽部靜脈迴流造成咽部區域性淤血），慢性支氣管炎，支氣管哮喘，風溼病，肝、腎疾病等，也可引發慢性咽炎。內分泌紊亂，自主神經失調，臭鼻桿菌及類白喉桿菌的感染，維生素缺乏及免疫功能紊亂等均與萎縮性及乾燥性咽炎相關。

5.過敏因素吸入性過敏原（包括季節性與常年性過敏原），藥物、工作環境中的化學刺激物及食物過敏原都可以引起變應性咽炎。