你的問題挺多，也都比較深奧，試著簡單回答一下。

1、有什麼好的方式 打磨靈魂的嗎？

答：當然有，各大宗教本質都是類似的目的。方法一是修心，也就是放下不執著，制心一處，常用的方法就是打坐、冥想、讚美、唸佛等方法。方法二是善行，也就是無私的大愛，慈悲喜捨。

2、二元論是真的嗎？二元論本身不夠準確，強行分割心和物，其實心物是一體的，也即空即是色、色即是空，也是量子力學所觀測到的。

3、靈魂獨立於身體 二元論到底是什麼？靈魂是永恆的，肉體是暫時的，靈魂可以脫離肉體存在，無數的西方瀕死體驗醫學臨床記錄可以證實這點，當然很多修行者也可以親證這點。

4、為什麼古希臘什麼的文化那麼燦爛？所謂家花不如野花香，其實中華民族的文化更燦爛，有心你自己去研究一下。從久遠來說，古印度和古埃及歷史和文化也是非常燦爛的，遠超古希臘。另外，歷史上多次出現比現在更發達的文明，例如姆大陸和亞特蘭蒂斯，這個有考古證實的，但這些包括上述幾個問題的內容在主流社會屬於禁忌話題，多數人不知道。

個人淺見，僅供參考。