幾個因素可能導致咖啡豆有煙燻味：

第一，在咖啡生豆處理過程中，咖啡豆在晾曬時，周遭環境中有煙燻味，會讓咖啡豆日後有這種味道；

第二，咖啡生豆儲存、運輸過程中，也可能因吸收周圍的味道，而讓咖啡豆日後有煙燻味；

第三，咖啡豆在烘焙過程中，如果深焙處理不當，或者咖啡生豆裡有瑕疵豆等，甚至咖啡生豆大小不一，造成烘焙不均勻，會產生煙燻味；

第四，咖啡豆選購回家，但是儲存不當，不是放在通風、陰涼、避光的環境裡，此時的咖啡豆因為已經烘烤過，咖啡豆本身更容易吸收環境的味道；

第五，如果烘焙後過早飲用（一天之內），也容易喝出煙燻味；

第六，如果咖啡存放過久，不新鮮了、氧化了，好的風味流失，容易嚐到煙燻味；

第七，有的咖啡生豆本身就自帶煙燻味，這很可能是它的生態環境造成的，要仔細看它的風味譜描述，有的羅布斯塔豆子是這樣的，也有阿拉比卡豆有這樣的特徵。

那麼，這些因素造成的咖啡豆煙燻味，影響的是咖啡品嚐的愉悅感，不一定對身體有害。