除少數山區仍採用農家品種外,種子市場上供應生產的玉米種子都是雜交種，玉米雜交種基本上又為單交種。所謂單交種是由兩個自交系組配而成，雜交種只有第一代才會表現出雜種優勢，表現為生長整齊健壯、抗性強、增產顯著。雜種一代植株所產生的種子為雜交種第二代，二代種如用於生產，長出的植株高矮不齊，果穗大小不一致，成熟早晚也不一致，雜種優勢顯著減弱，在遺傳上表現分離現象，導致嚴重減產。一代雜交優勢越大，其後代（第二代減產會越顯著。因為雜種第二代（F2）是由雜種第一代自由授粉得來的，在其群體株與株之間的遺傳基礎，已經不是搭配最好的了，而是好壞兼有，甚至接近原來父、母本自交系的遺傳基礎，分離出一些產量低的個體，使產量隨之顯著下降。單交種第二代產量下降最多，其他型別的雜交種第二代也均表現不同程度的減產。所以玉米雜交種不能留種，要年年配種，年年利用第一代，才能起到增產的作用部分農民群眾看到一代雜交種種子長出的玉米生長整齊一致、穗大粒多高產，誤認為可下季再種，就秋後自己留種第二年再種，結果會造成巨大損失。