當凝汽器冷卻水管結垢或被雜物堵塞時，便破壞了凝汽器的正常工作。使真空下降。因此必須清洗銅管，使其保持較高的清潔程度。 清洗方法通常有：

1、機械清洗。機械清洗即用鋼絲刷、毛刷等機械，用人工清洗水垢。缺點是時間長，勞動強度大，此法已很少採用。

2、酸洗。當凝汽器結有硬垢，真空無法維持時應停機進行酸洗。用酸溶液溶解去除硬質水垢。去除水垢的同時還要採取適當措施防止銅管被腐蝕。

3、採取乾燥法。凝汽器有軟垢汙泥時，可採用通風乾燥法處理，其原理是使管內的微生物和軟泥龜裂，在通水沖走。

4、反衝洗法。凝汽器中的軟垢還可以採用冷卻水定期在銅管中反向流動的反衝洗方法來清除。這種方法缺點是要增加管道閥門的投資，系統較複雜。

5、膠球連續清洗法。是將比重接近水的膠球投入迴圈水中，利用膠球透過冷卻水管，清洗銅管內鬆軟的沉積物。是一種較好的清洗方法，目前中國各電廠普遍採用此方法。

6、高壓水泵。（15—20MPa）。高速水流擊振沖洗法。