複音口琴和重音口琴音階的排列上沒有什麼區別，所不同的是兩種口琴各自的結構稍有不同。二者的音色及其用途不同。複音口琴同一孔中的上下兩格簧片厚薄相同，音高相同，而音色稍有不同，形成獨特的顫音效果；複音口琴音色清脆明亮，適合用於口琴獨奏、合奏、歌唱伴奏等；重音口琴與複音口琴結構大體相同，有著同樣的簧片排列和音階排列。不同之處在於同一個音孔中的上下兩格簧片厚薄不同，上格要比下格的薄一些，所以上下兩個簧片音高相差一個八度（上格比下格高一個八度）。重音口琴音色飽滿、宏厚低沉，帶點渾濁，由於上下兩格簧片音高相差一個八度，形成類似於雙簧管的音色，常常在樂隊中代替雙簧管。 適合二重奏、三重奏、及大合奏之用。但是重音不適合獨奏，吹起來也比較費力。

三者都屬於複音口琴一類，區別在於重音琴每孔的上下兩簧差8度，一般複音琴並非如此，回聲琴是在複音琴上加一個可供迴音的殼以增強回聲效果。初學者可以選擇C調24孔複音口琴，但不建議選擇複音口琴中的重音或重回音型別，這樣的建議都是從方便初學者聽音的角度出發的——C調較高，易區分，迴音和重音口琴有混響或和聲，不純。另外複音琴更便宜。