19世紀中期，在美利堅合眾國的密蘇里州聖彼得斯堡。

住著一位叫湯姆‧索亞的少年。湯姆幼年雙親去世，由波莉姨媽收養。聰明頑皮的湯姆受不了波莉姨媽和學校老師的管束，常常逃學。一天深夜，他與好朋友哈克貝利·費恩到墓地試試膽量，可是無意中目睹了一起兇殺案的發生。還有一次，湯姆、哈克帶著喬·哈波一起逃到一座荒島上做起了“海盜”，弄得家裡以為他們去世了，結果他們卻出現在了自己的“葬禮”上。在法庭上，經過激烈的思想鬥爭，湯姆終於挺身而出，指證了兇手，而這時兇手印江·喬埃已逃之夭夭。後來，湯姆和哈克在鬼屋中挖假象的寶藏時遇到了兇手印江·喬埃！他們聽見印江·喬挨要把他的金錢放在二號十字下面。在一次野餐活動中，他與他的同桌貝琪在一個巖洞裡迷了路。三天三夜不吃不喝，受盡了煎熬。更可怕的是，他們還在山洞裡看到了兇殺案的兇手——印江·喬埃！最終，湯姆靠牽著綁在石頭上的風箏線探路，找到了出口，走出了山洞。村裡人發現他們，他們講述了在洞中的經歷，之後，村裡人用鐵板堵住了山洞口。湯姆告訴村裡人在山洞裡見到了殺人犯印第安人喬，當村里人在洞中找到印江·喬埃時，他已經餓死了。最後，湯姆和哈克重返山洞，找到了一筆寶藏，成了這個鎮子的英雄。