兩者的區別主要在於其藥理不同，抑制胃酸類藥物應該是以抑制胃壁細胞分泌胃酸，而抗胃酸藥物應該是以中和胃酸為主。

1、臨床藥理不同：抗酸劑作用機制是中和已分泌的胃酸，緩解疼痛，促進潰瘍癒合。它有單成分製劑和複合製劑兩種，即單以碳酸類藥物或者由其合劑鹽類藥物組成，多是一些鹼性藥物，起到酸鹼平衡，最常見的是碳酸氫鈉。

抑酸劑則抑制胃酸的分泌，它作用於胃酸分泌的多個環節，使胃酸分泌減少。包括H2受體拮抗劑、質子泵抑制劑、選擇性抗膽鹼藥、胃泌素受體拮抗劑等。即H2受體阻滯劑，如西咪替丁，質子泵抑制劑奧美拉唑等。

2、用法不同：抗酸劑治療消化性潰瘍所需療程長，用藥較為麻煩，多在餐後1小時及臨睡前各服1次，每日4次服用。抑酸藥H2受體拮抗劑每日服用2次。質子泵抑制劑每日2次口服，抑酸效果很強，服用方便。

但因抗酸劑具有緩解症狀快、價格便宜的優點而仍被大家所應用。而抑制胃酸分泌藥物作用是抑制胃壁細胞分泌胃酸，緩解症狀沒有抗酸藥物快，但是抑制胃酸的藥物作用時間長，治療效果優於抗酸藥。