為了保證這個醫療的安全，保證病人的安全，在一些情況下是不能馬上進行造血幹細胞移植的，這就是禁忌證：

首先是嚴重的感染，帶著一個嚴重的活動性的感染，這時候病人的風險是非常的大的，尤其是像活動性的結核。所以臨床實踐中我們就得控制了感染之後，再進行移植。

其次是嚴重的臟器功能障礙，比如心功能不好，肝臟功能不好，或者是其它的臟器功能不好，這種情況的話也得是儘量的糾正好之後，再進行移植。

還有一種情況是不能忽略的，就是精神和心理，因為移植的時候，需要病人和親屬和醫護人員相互配合。如果配合不好的話，也會出現很大的風險，比如說像精神異常的病人，他往往是配合不好，在漫長的治療的過程當中，如果說配合不好，會給治療過程帶來極大的風險。所以說我們把精神性疾病也納為異基因造血幹細胞移植的禁忌。

當然其它的話，年齡也是一個因素，比如說年齡非常的大，是一個相對的一個禁忌，現在做移植的話，患者的年齡是會越來越大，當然隨著技術的提高，其實安全性也是一個相對的。