1、概念不同主要負責人指的是一個單位或組織主持本單位全面工作具有最高決策權並對本單位承擔主要責任的單位主要領導。法人代表，也可稱為法人的授權代表，這個代表可以是甲、也可以是乙，他不是固定的，而是取決於法人的授權，這個授權可以一事一授權，也可以是一攬子事項的授權。

2、負責內容不同法定代表人是法律規定的對外代表公司的，對公司全體事項承擔責任的人。主要負責人是主要負責公司整體或某一部門經營管理活動的人，如總經理、財務主管等。法定代表人可以不負責公司的經營活動。

3、法律後果不同依照法律或者法人章程的規定，代表法人從事民事活動的負責人，為法人的法定代表人。 法定代表人以法人名義從事的民事活動，其法律後果由法人承受。 法人章程或者法人權力機構對法定代表人代表權的限制，不得對抗善意相對人。法定代表人因執行職務造成他人損害的，由法人承擔民事責任。 法人承擔民事責任後，依照法律或者法人章程的規定，可以向有過錯的法定代表人追償。 而主要負責人是企業擁有最高決策權並承擔主要責任的領導。