嚴格說是空腹吃最好，吸收最佳，空腹吃後15-30分鐘後才吃其他食物。若臨睡前吃燕窩，建議臨睡前半個小時吃，這樣半夜才會不起身如廁而影響睡眠。以下為吃燕窩的最佳時間：

晚上23點至凌晨1點：主護造血、凌晨1點至3點：主護肝、凌晨3點至7點: 主護肺。在此必須注意，最佳時間是指吸收時間，所以必須在該時間的2-3小時前食用，若是液體則半小時前即可。

此外，看是要針對加強哪方面的系統的功能外，還得略用相關的佐料如：紅棗、枸杞子、桂圓、蟲草川貝、花旗參等輔助以便達到所要的功效。在我們燕窩原產地，燕窩是一道平日普通甜品，沒有分什麼時間段，但因為它是高檔的營養食品，所以一般人都建議在空腹時食用未達到更好的吸收。食用燕窩要達到養生的作用每次份量（幹燕窩）3克-5克就足夠供應人體一天所需要從燕窩中吸取的營養。至於季節的轉變則只是在配料方面下功夫。按照華人養生的知識，按照春夏秋冬各季節在燕窩中搭配合適的季節養生配料以期讓燕窩達到更好的養生保健功效。燕窩中含有獨特的一種蛋白酶自古至今燕窩是名貴的天然滋養養肺聖品。燕窩是滋養保健養生食品，燕窩對女人最大的好處是養肺其次是養顏。男人吃最大的好處是養肺其次是養腎。