病原微生物分為：朊毒體、寄生蟲（原蟲、蠕蟲、醫學昆蟲）、真菌、細菌、螺旋體、支原體、立克次體、衣原體、病毒。病原體侵入人體後，人體就是病原體生存的場所，醫學上稱為病原體的宿主。病原體在宿主中進行生長繁殖、釋放毒性物質等引起機體不同程度的病理變化，這一過程稱為感染。不過人體或動物不像人工培養細菌的培養基，可以讓病菌不受限制地肆意生長繁殖，輕易地導致機體死亡。病原體入侵人體後，在發生感染的同時，能激發人體免疫系統產生一系列免疫應答與之對抗，這稱之為免疫。病原微生物進入人體後會引發人體免疫。人類的面板和黏膜，他們不僅能夠阻擋病原體侵入人體，而且它們的分泌物（如乳酸、脂肪酸、胃酸和酶等）還有殺菌的作用。呼吸道黏膜上有纖毛，可以清除異物。機體免疫系統識別自身與異己物質，並透過免疫應答排除抗原性異物，以維持機體生理平衡的功能。免疫是人體的一種生理功能，人體依靠這種功能識別“自己”和“非己”成分，從而破壞和排斥進入人體的抗原物質，或人體本身所產生的損傷細胞和腫瘤細胞等，以維持人體的健康。