百香果本身病蟲害很少，有部分病蟲為害，主要是附近寄主上的病蟲遷移侵染為害，主要有薊馬、瓜實蠅、稻綠蝽。主要病害有苗期猝倒病，疫病，花葉病毒病，莖基腐病等。防治方法：

1、 要選擇乾淨土壤栽植，保持田間土壤含水量，防止積水，遠離各種瓜類，茄果類蔬菜與香蕉，及時清除燒燬病葉、病枝。

2、 藥物防治苗期猝倒病:猝倒立枯靈800倍液，苗菌敵800-1000倍液；疫病：世高1000-2000倍液，丙森鋅600-800倍液。花葉病毒病：小葉黃絕1000-1500倍液，病毒靈1500-2000倍液，菌毒斃2000-2500倍液。莖基腐病：多菌靈500-800倍液。主要蟲害主要蟲害有潛葉蠅、薊馬、蟎類等。防治方法：潛葉蠅：斑潛皇2500-3000倍液，阿維菌素6000-10000倍液。薊馬：喜訊3000倍液。蟎類：紅白蟎死3000-4000倍液，利劈蟎1500-3000倍液。預防措施預防為主，綜合防治為輔，提倡生態防治，把病蟲害控制在發病初期。注：以上農藥禁止在採果前30天使用，否則食後對人體健康有害。