冠脈支架術是內科醫生做的，創傷小，就像打針一樣，區域性麻醉（區域性打一隻利多卡因）就行了，手術快，恢復也快。但存在主要問題是術後有支架再狹窄和血栓等問題，術後必須應用雙聯抗血小板聚集藥一年，手術指徵也有一定侷限性（如多支病變，無保護的左主幹病變等可能冠脈搭橋更合適）。冠脈支架需要在X線下做，有放射輻射影響，且造影劑也對腎臟有一定影響。

而冠脈搭橋是心臟外科醫生做的，需要開胸創傷大，全身麻醉、體外迴圈支援（當然目前也有不停跳搭橋的趨勢）。很多患者就是因為身體不能耐受開胸手術的創傷，放棄了搭橋手術。但搭橋手術術後通常率相對較高，且很多支架不能解決的問題都能解決（如多支病變、慢性完全阻塞性病變、支架後再狹窄等）。

總體來講，冠脈支架手術創傷小，特別是急性心梗的患者立竿見影；而搭橋手術創傷大，但遠期效果可能相對較好（特別是前降支的動脈橋通暢率最高，十年通暢率在90%以上)。如果身體都能耐受的話，支架可能更適合一些簡單的病變，冠脈搭橋更適合複雜的病變。當然，兩者之間還有費用等的區別（支架多的費用高），但最重要的還是效果之爭（近期、遠期）。