細胞學說論證了整個生物界在結構上的統一性，以及在進化上的共同起源。這一學說的建立地推動了生物學的發展，併為辯證唯物論提供了重要的自然科學依據。恩格斯曾把細胞學說譽為19世紀最重大的發現之一。

施萊登和施旺的細胞學說為19世紀細胞的研究指出了方向。然而，他們雖然正確地指出新的細胞可以由老的細胞產生，卻提出了一個錯誤的概念即新細胞在老細胞的核中產生，由非細胞物質產生新細胞，並透過老細胞崩解而完成。由於這兩位科學家的權威，使得這種錯誤觀點統治了許多年。

許多研究者的觀察表明，細胞的產生只能透過由原先存在的細胞經過分裂的方式來完成，1858年德國病理學魏爾肖概括為“一切細胞來自細胞”的著名論斷，這不僅在更深的層次上揭示細胞作為生命活動的基本單位的本質，而且通常被認為是對細胞學說的重要補充，甚至有人認為直至於此細胞學說才全部完成。

儘管細胞學說的某些部分已成為歷史的陳跡，然而其中心思想仍廣泛而深刻地影響了後來生物學的發展，任何生物學的重要問題都必須從細胞中尋求最後的解答。