除了飢餓，肚子咕咕叫還有很多原因，如腸易激綜合徵。胃腸道內無實質病變，但功能、菌群紊亂，各種有害細菌在腸道內發酵產生大量氣體，使腸蠕動幅度擴大，導致腸功能亢進，就會出現腸鳴。這種腸鳴可以服用腸道益生菌來抑制有害細菌從而減輕症狀。

消化不良，食用了難以消化或者很容易產生氣體的食物（如土豆、紅薯、牛奶等），或者胃本身消化失調，導致腸道微生物分解產生大量氣體時，經常會聽到胃發出咕嚕聲。如果乳糖不耐者喝完牛奶拉肚子時，腸蠕動加速，咕嚕聲會更響。如果不想增加胃的負擔，那麼以後少吃這些東西比較好，乳糖不耐症的人可以選擇不含乳糖的牛奶。

腸梗阻，腸梗阻的危害可大可小，輕度便秘，嚴重者是會致命的。梗阻使腸腔不斷吸進空氣積聚了很多氣體、液體，另外就是腸道菌群分解和發酵產出的氣體，液體由腸道分泌，大量的氣體和液體會引起腸道擴張、腸蠕動，從而導致腸鳴。如果腸梗阻加強，腸腔內壓力過大，靜脈迴流受阻，腸壁充血水腫，嚴重時可導致腸缺血而壞死和穿孔。

消化道出血，腸鳴音突然增強、頻繁，有可能表示消化道出血。消化道出血後，血液進入腸道，加劇腸蠕動，導致腸鳴音亢進；如果腸鳴音嚴重，伴有咯血、便血的症狀，那時就必須抓緊到醫院治療。