免移蟲器可以幫助養蜂人節省人工移蟲的工作，養蜂人在使用免移蟲器的操作步驟，為了提高工蜂清理育王盒的積極性，提高蜂王在塑膠王臺基內產卵的積極性，需要對免移蟲盒和塑膠王臺基進行處理，養蜂人將塑膠王臺基和免移蟲盒放入蜜糖水中浸泡2小時~4小時，讓蜜糖水浸入免移蟲盒的各個角落，這時養蜂人將免移蟲盒和塑膠王臺基取出，清理出多餘的蜜糖水之後，再將免移蟲盒調入強群。

養蜂人在使用免移蟲器需要注意，免移蟲盒和王臺基是塑膠製品容易散發塑膠氣味，會影響工蜂清理免移蟲器的積極性，塑膠王臺基內幼蟲的接受率也會降低，同時，免移蟲盒的體積和空間較大，強群內工蜂數量較多，養蜂人讓強群清理免移蟲盒的時間可以適當延長，有利於蜂群更好的清理免移蟲盒和塑膠王臺基。

強群內工蜂會進入免移蟲盒進行清理王臺基的工作，工蜂清理免移蟲和一天左右的時間，這時養蜂人將免移蟲盒提出檢查，確定蜂群已經完成清理工作，養蜂人可以用菸斗捕王器，幫助原蜂群內蜂王進入免移蟲盒，蜂王會主動在王臺基內產卵，養蜂人檢查免移蟲盒內王臺基上出現蜂卵，這時養蜂人可以將王臺基固定在育王框，蜂群的免移蟲工作完成。