手術：肥厚性心肌病的手術根據具體情況、嚴重程度、醫院所在地、醫院收費標準幾方面不同，而有所差異。一般一次手術費用約3萬元，加上住院費、掛號費、檢查費、藥費等需要4—6萬元左右，較嚴重者單次手術費用在3萬無以上，大多患者在數年中往往需要多次手術，所以手術治療肥厚性心肌病總體花費在4—10萬元左右（平均6萬元以上），位置特殊、手術難度大、危及生命的嚴重者需10萬元以上，有的可達到數十萬元。

化學消融術：化學消融術是一種最近幾年比較常用的治療肥厚性心肌病的方法，屬介入治療範圍，較手術治療來說，創傷小，效果更進一步，是現在一些醫院的主推手段。一般一次治療費用在3.5—4萬元左右。

無論手術還是化學消融術往往需要後期常年服藥，也需要大量的藥費來維持病情不反覆。

心臟移植：肥厚性心肌病心臟移植的話費用可達十幾萬，甚至數十萬元。這些高昂的費用對一般的工薪階層的家庭來說是極難承擔得起的。

西藥：服用西藥費用也需要數萬元之多，且最好的療效也僅能達到維持症狀不嚴重，而西藥有一定的副作用，不能久用，否則傷害很大，老病未除，又填新病，那就得不償失了。