何首烏表面為紅棕色或紅褐色，皺縮不平，有淺溝，切面為淺黃棕色或紅棕色，有異型維管束環列，形成雲錦狀花紋俗稱“筋”，質堅實。

切片為不規則皺縮狀的塊片，厚約1釐米。表面黑褐色或棕褐色，凹凸不平。質堅硬，斷面角質樣，棕褐色或黑色。氣微.味微甘而苦澀。

橫切面：木栓層為數列細胞，充滿棕色物。韌皮部較寬，散有類圓形異形維管束4～11個，為外韌型，導管稀少。根的中央形成層成環；木質部導管較少，周圍有管胞及少數木纖維。薄壁細胞含草酸鈣簇晶，直徑10～160微米；並含有澱粉粒。本品粉末黃棕色。澱粉粒單粒類圓形，直徑4～50微米，臍點人字形、星狀或三叉狀，大粒者隱約可見層紋；復粒由2～9分粒組成。草酸鈣簇晶直徑10～80～160微米，偶見簇晶與較大的方形結晶合生。棕色細胞類圓形或橢圓形，壁稍厚，胞腔內充滿淡黃棕色、棕色或紅棕色物質，並含澱粉粒；具緣紋孔導管直徑17～178微米。棕色塊散在，形狀、大小及顏色深淺不一。

斷面的雲錦花紋猶如樹木的年輪，記載了何首烏的年齡，年輪越多年份越大。