輔酶-------由於輔酶在酶催化反應中其化學組分發生了變化，因此可以認為輔酶是一種特殊的底物或者稱為“第二底物”。這種所謂的第二底物可以被許多酶所利用。例如，目前已知有約七百種酶可以利用輔酶NADH進行催化。 在細胞內，反應後的輔酶可以被再生，以維持其胞內濃度在一個穩定的水平上。例如，NADPH可以透過磷酸戊糖途徑和甲硫氨酸腺苷基轉移酶作用下的S-腺苷基蛋氨酸來再生。由於輔酶的再生對於維持酶反應體 硫胺素

系的穩定是必要的，因此，輔酶再生系統獲得了大量的實驗室以及工業應用。

輔基---- 酶的輔因子或結合蛋白質的非蛋白部分（其中較小的非蛋白質部分稱輔基），與酶或蛋白質結合的非常緊密，用透析法不能除去。按照化學組成，酶可以分為簡單蛋白質和結合蛋白質兩大類。胃蛋白酶、核糖核酸酶等一般水解酶屬於簡單蛋白質，這些酶只由氨基酸組成，此外不含其它成分。轉氨酶、乳酸脫氫酶及其他氧化還原酶等均屬於結合蛋白質。這些酶除了蛋白質組分外，還含有一對熱穩定的非蛋白的小分子物質，前者稱為酶蛋白，後者稱為輔因子。酶蛋白與輔因子單獨存在時，一般無催化能力，只有二者結合成完整的分子時，才具有活力，此完整的酶分子稱為全酶。