從你敘述的情況看，第三人翻建房屋是得到政府規劃部門批准，房屋翻新屬於合法建設行為。你要維護自己合法權益，應撤銷政府批准建房手續或補償你的損失。

從你提供的情況看，一審、二審都認為政府合法，你要申請再審，可以選擇的理由主要是《行政訴訟法》第九十一條這兩項：原判決、裁定認定事實的主要證據不足、未經質證或者系偽造的；原判決、裁定適用法律、法規確有錯誤的。首先，你應當檢視規劃是否符合國家法律、行政法規、規章等，如果有違法之處，政府機關行為就是違法。其次，你確認法院對採光通風影響情況的認定是否證據確鑿。第三人在原批准建房地界內翻建，雖然房屋長寬發生變化但總面積沒變，樓房間距符合當地採光通風規定，。樓房間距是否影響採光通風，不是我們日常感覺判斷，例如你家離他家10米遠，現在變成5米，以前日照時間從早晨到傍晚，他家翻建後變成早10點到下午2點，你覺得影響太大了，按照標準，每天滿窗日照時間應該不少於1小時就是合格的。如是前述情形，你翻案的機會很小。

申請行政訴訟再審，當事人一般應當在判決、裁定生效之日起六個月內提起再審。

不是上訴，是申請再審也叫申訴。關於你這個問題比交特殊，以總平面積不超所以二審都認為合法而判你敗訴了。而你為超了原長度你不服是吧。這裡所說的是關於民法的規定超長之後對你的生話有沒有影響（比喻採光等等）。如確有影響的話！必須經相關有資質的專業部門的鑑定，認為確實對你的生產生活造成影響了，你方可走下步的司法程式。否者不必了。筆者說你一句：這種案件你的成功率幾乎為零。忍一忍吧！低頭不見抬頭見的！請你定奪吧！筆者是建議而己。