製藥工程屬於工科類專業。重點應該在下游技術，也就是工業生產技術之類的，包括工廠成品生產、儀器裝置的應用等，這類成品大都投入市場應用，化工是技術基礎。而上游技術主要是實驗室的小規模研究和合成。同時製藥現階段還是以化學合成為主，化學和藥學是理論基礎。在比較有優勢的學校，這專業可能在藥學院或生科院。在工科類學校，這會編入輕工化工類學院。以我的學校為例，食品工程、生物工程、製藥工程、應用化學、化工同屬一個學院。 製藥工程專業是屬於藥學類專業。

製藥工程是一個化學、藥學（中藥學）和工程學交叉的工科類專業，以培養從事藥品製造，新工藝、新裝置、新品種的開發、放大和設計人才為目標。藥學各分支學科的基本理論和基礎知識，接受藥學科研方法和技能的基本訓練。具備較紮實的基礎和較寬廣的專業知識。培養能從事藥物化學、藥物分析、藥物評價、臨床合理用藥、醫藥經營及管理、新藥研究與開發、藥品生產與管理等方面工作的高階科學技術人才為目標。以理科類專業。就業方面在我們這裡差不多。兩個專業那個好一些呢？主要的還是靠學校呢。