一、定位不同1、鋼之鍊金術師：是根據日本漫畫家荒川弘創作的漫畫作品改編的同名電視動畫。2、鋼之鍊金術師FA：是根據日本漫畫家荒川弘創作的漫畫作品改編的二度動畫化作品，採用原作漫畫劇情，一般簡稱“鋼之鍊金術師FA”。二、劇集不同1、鋼之鍊金術師：電視動畫由BONES製作，於2003年7月釋出製作動畫版的訊息，2003年10月4日開始在MBS/TBS系電視臺播放，至2004年10月2日完結，全51話。2、鋼之鍊金術師FA：電視動畫由BONES製作，於2009年4月5日起在日本MBS/TBS系電視臺播放，至2010年7月4日完結，全64話。三、特性不同1、鋼之鍊金術師：動畫企劃時，原作漫畫進度當時僅出版到單行本第5卷，於是後期部分劇情需要由原作者荒川弘提供漫畫分鏡稿給動畫製作組說明場景 ，動畫劇情前半以原作漫畫單行本前7卷劇情為基礎大幅改編。2、鋼之鍊金術師FA：動畫標題是在漫畫原作標題《鋼之鍊金術師》的後面新增漫畫原作英文標題合成標題《鋼之鍊金術師 FULLMETAL ALCHEMIST》，但在日本海外發行時，為避免前作動畫《鋼之鍊金術師》的海外英文名稱《FULLMETAL ALCHEMIST》產生混淆。