1、形成不同

信使RNA是由DNA的一條鏈作為模板轉錄而來的、攜帶遺傳資訊的能指導蛋白質合成的一類單鏈核糖核酸。

轉運RNA，簡稱為tRNA，是一種由76-90個核苷酸所組成的RNA，其3"端可以在氨醯-tRNA合成酶催化之下，接附特定種類的氨基酸。

2、功能不同

轉運RNA主要是攜帶氨基酸進入核糖體，在mRNA指導下合成蛋白質。即以mRNA為模板，將其中具有密碼意義的核苷酸順序翻譯成蛋白質中的氨基酸順序（見蛋白質的生物合成、核糖體）。

信使RNA

1、mRNA是合成蛋白質的直接模板。每一種多肽鏈都有一種特定的mRNA做模板，因此細胞內mRNA的種類也是很多的；它將DNA上的遺傳資訊轉錄下來，攜帶到核糖體上，在那裡以密碼的方式控制蛋白質分子中氨基酸的排列順序，作為蛋白質合成的直接模板。

2、tRNA的功能是轉運氨基酸。在蛋白質合成過程中，tRNA與合成蛋白質所需的單體——氨基酸形成複合物，將氨基酸轉運到核糖體中mRNA的特定位置上。