荊芥是治療感冒的一個常用藥物，可用來祛風解表散寒，凡是遇到風寒感冒，很多藥物配方里面都會搭配荊芥，性質辛溫，有發散風寒的作用，風寒感冒導致的畏風畏寒、頭身疼痛、鼻塞流涕等症狀，可用荊芥；在一些風熱感冒，適當的加入荊芥，也能夠加強解表的功效，比如銀翹散裡面就用到荊芥。

臨床上荊芥也經常搭配防風，是一個經典的藥對，這兩個藥都有辛溫解表、疏散風邪的作用，兩藥合用能加強這方面的功效。

肺主皮毛，荊芥辛溫解表祛風的特性，除了治療感冒之外，也常用於治療各種面板病症，面板瘙癢風團癮疹等病症，也經常祛風止癢祛溼清熱的配方基礎上，加入荊芥、防風等藥物，能夠引導諸藥入面板，比如消風散內就會用到這些藥物。

這荊芥還有一個功效比較少被人知道，就是它有良好的止血的作用，尤其是荊芥炒黑為炭了之後稱為荊芥炭，能夠治療吐血、便血、崩中漏下等多種出血症狀。

荊芥的乾燥花穗稱為荊芥穗，這個藥物功效和荊芥雷同，但是祛風解表透疹的功效更為突出，也常用於表證或者面板病，風疹瘡瘍不透的症狀。

荊芥性質偏溫燥，陰虛內熱、津液不足的人不宜過度使用。