雙硬碟雙系統無非兩種方案：1. 雙硬碟單引導分割槽。兩個硬碟分別裝兩個系統，兩個系統分主從；在主系統所在盤上劃分EFI分割槽，從系統所在硬碟不劃分EFI分割槽；兩個系統的引導都放在主系統硬碟上的EFI分割槽，兩個系統共用一個載入程式，一般是grub2。開機使用grub2選擇系統。這是絕大多數的做法這樣的優點是引導簡單，絕大多數電腦都可以快速選擇系統；缺點是主系統刪除麻煩，還得重新建立從系統的引導2. 雙硬碟雙引導分割槽。這樣的方案適用於開機可以快速選擇啟動硬碟的電腦，比如本人之前的神州k670e，開機按esc即可快速選擇啟動硬碟。具體實現方法：單獨安裝一個硬碟，分別給兩個硬碟做好系統，然後再將兩個硬碟都放入電腦。如果使用這種方式，兩個硬碟分別各有一個EFI分割槽，各自有各自的載入程式；系統的引導檔案分別在各自的硬盤裡面，互不干擾；兩個系統分別使用各種的載入程式進行引導，即Linux使用grub2, Windows使用Windows boot manager；開機透過選擇硬碟進行系統的選擇，而不是載入程式選擇系統這樣的優點是裝雙系統隨意搞，一個系統搞垮完全不會影響另一個系統，刪除任意一個系統也不需要重新建立引導；缺點是部分電腦選擇啟動硬碟可能比較麻煩，視情況而定