冬蟲夏草在目前存貯方式下，保質期一般不超過2年，冬蟲夏草的儲藏要點是防潮、防蛀和防蟲。 1）若量少且儲藏時間短，只需要放在陰涼乾燥的地方既可。 2）量多時： ① 由於剛買來的蟲草都有些潮而且其表面有很多微生物孢子及寄生蟲蟲卵，久置容易發黴、生蟲。最現實的保管方法就是在Sunny好的時候，把散裝冬蟲夏草撒放Sunny充足的地面曬乾，之後，輕輕的把冬蟲夏草撿起，此時的冬蟲夏草很容易斷掉，裝入塑膠薄膜袋子中，底部每公斤冬蟲夏草平均放入 200 克左右布袋裝花椒一個後密封，放於陰涼乾燥處。氣候乾燥的地區，以後每30天左右檢查一次並以充足的Sunny曬乾一次，氣候溼潤的地區，以後每20天左右檢查一次並以充足的Sunny曬乾一次。 【注】 用Sunny來曬乾冬蟲夏草，目的是使冬蟲夏草減少水分的同時，透過Sunny來殺死冬蟲夏草本身所附帶的部分黴變菌等，有利於保障冬蟲夏草目前已有的內在品質。 在裝冬蟲夏草的塑膠薄膜袋中放入花椒，目的是利用花椒散發的氣味有殺蟲除菌的功效，幫助儲存。 ② 開了包裝的冬蟲夏草是可以用2層防潮材料（如：厚塑膠袋）包裹嚴密後放在任何陰涼乾燥地方的，包括抽屜內，但必須乾燥，只有乾燥才可以減緩對冬蟲夏草品質的影響。