一次性口罩與非滅菌的區別有很多，例如前者的滅菌程度和標準會大於非滅菌型的，生產車間的無菌級別也會高於非滅菌型。並且兩者的微生物指標也不一樣，前者要求無菌，而後者只是對微生物有限度要求。

1.滅菌程度

滅菌程度是一次性口罩滅菌與非滅菌的區別之一，雖然兩者都是在無菌車間生產的，但是滅菌型口罩的滅菌程度和標準會遠遠大於非滅菌型，且生產滅菌口罩車間的無菌級別會高於非滅菌型。

2.微生物指標

一次性滅菌型口罩和非滅菌型口罩都屬於一次性醫用口罩，都是按照YY/T 0969的規定生產的，但是兩者對口罩的微生物指標也有所不同，滅菌型口罩要求無菌，而非滅菌型口罩只是對微生物有限度要求。

3.用途

非滅菌一次性口罩通常指的是普通的防塵口罩，這種口罩在工廠車間使用的比較多，平時遇到霧霾天或大風天氣，也可以佩戴這種口罩進行防護，而滅菌口罩在醫院使用的比較多。

注: （非無菌是指符合微生物控制標準，即允許有一定量細菌，但是在可控制範圍內，無論是非滅菌還是滅菌口罩均有防護功能，都可以阻隔一定飛沫，防止感染的）