先秦時期，姓和氏是有嚴格區分的，"姓”是區分宗族的標誌；“氏”是區分宗族分支的標誌。準確地說，孔並不是孔子本人的姓，而是他的氏。男子是隻稱氏，不稱姓的。

孔子是宋國貴族微仲的第十四代孫。按照中國五服制的宗法制度，出了五服就要別立一族，起新氏號。所以，微仲傳到第六代，得孔氏，是為孔父嘉。孔父嘉子木金父，木金父子祈父，祈父子孔防叔，孔防叔的孫子叔梁紇就是孔子的父親。

但是，孔氏雖然從孔父嘉開始別立一族，但那時男子的名號並不象現在前為姓後為名字這麼規範，稱氏，稱名，稱字，似乎並無一定之規，所以，孔父嘉以後，孔子的先祖如木金父、祈父、防叔、伯夏、叔梁紇，都不稱氏，其名號中都無孔字，比如，叔梁紇，“叔梁"是孔子父親的字，“紇”是孔子父親的名。孔氏一系，名號中稱氏的，是從孔子開始，其後固定下來，如孔子的兒子叫孔鯉，孫子叫孔伋，曾孫叫孔白，玄孫叫孔求，等等。後來，氏變成了姓，孔也就由氏變成了姓。