植物真菌性病害，按病原物分類，為卵菌綱、子囊菌綱、擔子菌綱和半知菌類。其中卵菌綱是低等真菌，其它三個綱是高等真菌。對於應用者來說，有個訣竅識別。即除了早疫病外，其它病名但凡含有霜黴、疫黴、霜疫黴、晚疫、腐黴等，都是低等菌病害。而高等菌病害種類繁多，不一而足。卵菌綱病害的藥劑選擇和使用注意事項。具體病害防治要有針對性，這裡就不詳細說明了。

低等真菌一般指的是鞭毛菌亞門的真菌一般引起的病害為：霜黴病、疫病、猝倒病、黑脛病等，藥劑有：勃生肥，甲霜靈、精甲霜靈、霜脲氰、霜黴威、烯醯嗎啉、苯霜靈、氰霜唑等。高等真菌包括擔子菌亞門、子囊菌亞門、半知菌亞門等，防治藥劑也要根據不同病害來選擇，比如白粉病：勃生肥、三唑類殺菌劑、乙嘧酚、二氰蒽醌等。炭疽病：咪鮮胺、抑黴唑、溴菌腈等。鏽病：等離子體殺菌劑、三唑類殺菌劑。現階段大多數殺菌劑殺菌譜都很廣，比如勃生肥、多菌靈、嘧菌酯、甲基硫菌靈、苯醚甲環唑等，對大多數病害都有效果。 一般情況下防治低等真菌的藥劑對高等真菌無效，而防治高等真菌的藥劑對低等真菌都有一定效果。