MPA學位培養的是新型高層次公共事務、政府管理和政策研究與諮詢的高階人才。與管理學碩士的主要區別在以下三個方面。

一、招生情況不同

專業碩士MPA招生，需要一定的工作經歷,絕大多數須經所在單位同意。初試考試科目有管理類聯考綜合和英語兩門。

管理學普通碩士，需要在每年的12月份左右，參加“全國碩士研究生統一入學考試”，並不存在工作經驗之類的限制。

二、學習方式不同

管理學普通碩士是全日制學習，年限一般為三年。

專業碩士分為全日制學習和在職學習，入學後可提交申請，經批准後變更學習方式。

MPA專案的培養方式一般是校內課程學習與校外調研、實習相結合，課程學習佔去大部分時間，大約2/3，問題研討和實習約佔1/3時間。

三、認可程度

MPA與管理學碩士在畢業時符合學位條例和考核的規定後都會頒發學位證與畢業證(雙證)。

在學術領域普通管理碩士的認可度高於專MPA 的認可度；但在市場或社會角度MPA認可度會高於普通管理碩士。因為MPA的招考背景本身就很注重申報者的工作背景與實際經驗,其認可度和求職地位也在逐年上升。