第一，被光緒之弟載灃所殺。

慈禧去世後，載灃掌權，傳聞載灃派人將李蓮英暗殺。原因很簡單，李蓮英被認為是毒死光緒帝的罪魁禍首，為了替光緒報仇，載灃派人潛入李蓮英家中，將其暗殺，同時割下了他的頭顱，將身軀扔到荒郊野外。

一次步兵統領江朝宗請李蓮英吃飯，飯後，李蓮英乘坐人力車回家，當街遇到劫匪，奪其錢財取其命，還割其頭顱，將身軀扔到了後海之中，待李蓮英家人趕到，只剩下了一顆頭顱，只能草草埋葬。

據說李蓮英在山東有位侄女，因為沒有近親，李蓮英決定前往山東探望。結果到了山東和河北的交界處，李蓮英遇到劫匪，劫匪不僅將身上的財物搶劫一空，還下狠手殺掉了李蓮英。等官府趕到時，只剩下了頭顱還留在現場，只能帶回去埋葬。

1911年3月4日，李蓮英去世，被埋葬在了恩濟莊。李蓮英死後不久，就有傳聞說李蓮英沒有身軀，只剩頭顱，甚至頭顱都有可能不是李蓮英的。