有區別：前者已經是專科醫生，本科學歷；後者是研究生學歷，執業醫師。選擇“5+3”相當於直接保研本校，選擇讀完5年後考研，可以選擇其他的學校繼續學習，你可以考研到更好的醫學院，像5+3這種模式，有點類似於被套牢，你的研究生學校跟本科學校綁定了，如果你本身很滿意本科的學校，那自然不用擔心這種問題。

另外，第一個選擇的範圍不同。

臨床醫學“5+3” 本科階段：第1-5年本科階段培養參照普通臨床醫學五年制本科培養目標和培養要求進行,並增設兒科學相關專業課程。

研究生階段：5年本科階段考核合格者直接進入3年臨床醫學碩士專業學位研究生教育階段，培養採用理論學習、臨床輪訓與導師指導相結合的方式，以臨床輪訓為主。

第二個、 時間花費上有所區別。

理論上講，八年制同學會花一年半搞科研，一年半臨床，五年制同學會花一年時間實習，考上研(專業型)後會花3年住培。但實際不完全是。大部分五年制同學有半年的實習是在打醬油的，他們去準備考研去了。而這個過程中，人壓力會非常大，會在非常大的高壓下，努力再把醫學教材背半年——這是學完後的回頭看，感悟自然不同。