二風扇風扇介面可以互換，但因主機板不同，其風扇調的調速功能，可能會受到制約。　　

1、主機板上的二風扇插座中，CPU的多為四針插座，而機箱的多為三針插座，偶有四針。四針插座說明主機板支援風扇調速功能；三針插座則僅為有測速功能，不能調速；　　

2、當CPU風扇連線機箱扇座，機箱扇座若為三針位的，CPU風扇將全速運轉，如3000轉或以上；若為四針座，則有可能享受調速功能。可進BIOS檢視“power"管理相關選項，或”系統健康“選項，是否機箱風扇也享有調速控制設定項；　　

3、當機箱風扇插到CPU扇座時，機箱風扇有二線、三線兩種形式，二線透過直連電源四孔介面連線，全速運轉。三線風扇（有防呆口不易插錯）此時也不能享受調速功能，只能被測速。且所測速度值也是互換調位的；　　

4、CPU風扇因不能被自動調速，高速噪聲較大，可更換同尺寸低速風扇。但若為遊戲機，這樣做不妥。最好還是將機箱風扇的電源線接長，絕緣處理好插回原位；則CPU風扇還是歸位為好。

這兩個不能互換使用。CPU風扇是放在CPU上面，透過矽脂傳導熱量，然後給CPU降溫的。

機箱風扇一般是在機箱的側面或背面，是給機箱裡所有的硬體來進行降溫的，再有就是這兩種風扇的供電線束的接頭大部分情況下是不一樣的，最後就是CPU風扇比較小，而機箱風扇比較大，機箱風扇是不太容易用到CPU上面的。