蓮花代表清淨，一塵不染。雖然它處在極惡劣的泥塘，但是依然影響不了它，開出芬芳美麗的花華。 因為有此含義，所以佛教一般的法座是蓮花座。 並非所有佛菩薩都坐蓮花的。比如大日如來坐獅子座，釋迦牟尼佛座金剛座，孔雀明王坐的是孔雀，以及不動明王坐的法座是磐石等等。

如本法師答：佛菩薩為什麼都坐蓮花，而不坐其它之花呢？

如本法師答：蓮花(學名Nelumbonucifera)表徵清淨無染，光明自在的意思，因為蓮花出於汙泥而不染，這種美德與特徵，佛陀喜歡拿蓮花作譬喻。

眾生輪迴六道，沉迷五欲(梵語panca kamah)六塵(梵語sad visayah)，不知決覺悟，越陷越深。慈悲的佛陀就告訴我們說：五欲六塵之慾樂，沾不得，染不得，應該體會五欲六塵空幻不實，如幻如化，要出離五欲六塵才能解脫自在，修學佛法者，要效法蓮花出於汙泥而不染之精神。

蓮花在佛門中，為佛菩薩所常拿來作譬喻，表徵著清靜、無染、光明、自在、解脫之義。其它之花，佛陀就較少比喻，佛陀坐蓮花顯的很莊嚴，清淨自在，安詳無比；假使佛陀坐在茉莉花上，不是顯得怪怪的嗎？不但不莊嚴，而且佛陀當下就顯得沒有氣質了，遜色多了，不是嗎？