T淋巴細胞主要是兩種功能：其一是直接殺死已被感染的細胞；另一個是提升體內的免疫反應，幫助其他免疫細胞清除病原體。T淋巴細胞主要針對細胞內的病原體，也就是細胞免疫的一部分。B淋巴細胞主要功能是三種：

1. 分泌抗體，抗體用於中和病原體產生的有害物質，或者用於結合病原體的抗原決定簇，防止病原體感染其他細胞。

2. 分泌細胞因子調節免疫反應（主要是抑制免疫反應）。

3. 抗原呈遞。B淋巴細胞主要針對細胞外的病原體，也就是體液免疫的一部分。在未感染狀態下，T淋巴細胞和B淋巴細胞處於非啟用狀態，但仍然擁有一部分調節自身免疫的功能。在被感染情況下，兩種細胞都會被啟用。巨噬細胞就是抗原呈遞細胞，負責吞噬、消化病原體，並且將抗原決定簇呈遞給T淋巴細胞，用於促進針對特定病原體的免疫反應。

巨噬細胞參與的是非特異性免疫及在特異性免疫的感應階段起處理呈遞抗原的作用，它不能特異性識別抗原，T細胞能特異性識別抗原，進行細胞免疫，參與的是特異性免疫。