消毒劑的種類非常多，不同的品種在養殖中使用的時機也不同。

1 生石灰。

這個是一個傳統的，但是效果非常好的消毒劑。主要是用在場地地面的消毒。可以減少雞主要活動場地中的病原菌，清除地面，牆壁縫隙中殘存的蟲卵等的危害。

除了生石灰，地面消毒使用火鹼也很普遍，效果也不錯。

2 福爾馬林。

高錳酸鉀和甲醛以1：2的比例使用，主要用於雞舍等位置的整體消毒，消毒效果不錯。這也是比較傳統的消毒方式，現在逐漸已經退出市場。主要是雞舍會殘存甲醛等有害氣體，等雞雛進入以後，雞舍升溫，這些殘存的甲醛揮發，會刺激雞的呼吸系統。同時，對人的危害也很大，使用不方便。

3 二氯異氰尿酸鈉

雞舍空舍消毒一種比較常見的消毒劑，這種消毒劑很快揮發，對場地殘存危害不大，但是很容易出現消毒不徹底等情況。

4 聚維酮碘。

比較常見的消毒劑，刺激性比較小，可以帶雞消毒，類似的產品還有百毒殺等。

除了這些消毒劑，還有一些中成藥的成分組成的煙霧彈，以及水線消毒的酸化劑等，總之消毒劑的種類非常多，根據養殖的不同時期，採用不同消毒劑進行消毒。