多睦健康來科普，胚胎幹細胞與胚胎進行嵌合克隆動物，可解決哺乳動物遠緣雜交的困難問題，生產珍貴的動物新種。亦可使用該項技術進行異種動物克隆，對於保護珍稀野生動物有著重要意義。

用胚胎幹細胞生產轉基因動物，可打破物種的界限，突破親緣關係的限制，加快動物群體遺傳變異程度，可以進行定向變異和育種。利用同源重組技術對胚胎幹細胞進行遺傳操作，透過細胞核移植生產遺傳修飾性動物，有可能創造新的物種;利用胚胎幹細胞技術，可在細胞水平上對胚胎進行早期選擇，這樣可以提高選樣的準確性，縮短育種時間

細胞治療是指用遺傳工程改造過的人體細胞直接移植或輸入病人體內，達到治癒和控制疾病的目的。胚胎幹細胞經遺傳操作後仍能穩定地在體外增殖傳代。以胚胎幹細胞為載體，經體外定向改造，使基因的整合數目、位點、表達程度和插入基因的穩定性及篩選工作等都在細胞水平上進行，容易獲得穩定、滿意的轉基因胚胎幹細胞系，為克服目前基因治療中匯入基因的整合和表達難以控制，以及用作基因操作的細胞在體外不易穩定地被轉染和增殖傳代開闢了新的途徑。