首先告訴你,Tm值沒什麼用的,你要注意的是退火溫度,比如這是我做16S rDNA的程式,1)95度 10min(這個一般用94-95度,使DNA完全分開,這步一般固定)2)95度 30秒(94度、95度都可以,這步幾乎也是固定的)3)退火溫度 30-60秒(退火溫度你設計引物時會有告訴你的,要是是大片段,將程式建議的退火溫度減去5度,小片度就可以按照它給的溫度,注意,退火溫度是PCR的關鍵,所以一般需要摸索條件的)4)72度 延伸時間(這步固定,延伸時間與你P的片段大小和你的Taq酶有關,一般是1-2kb/min,也就是說你做1kb大小的片段就用30-60秒,依次類推)步驟2-4迴圈30次5)72度 5-10min6)15度 10min(此步可有可無)希望可以幫到你!! Tm值在你設計引物的時候才會有用,引物的Tm值一般控制在55-60度, 儘可能保證上下游引物的Tm值一致,一般不超過2度. 如果引物中的G+C含量相對偏低,則可以使引物長度稍長,而保證一定的退火溫度.不知道你懂了沒? 當然,我引物Tm值差5度的也有,照樣P的很好,呵呵。
首先告訴你,Tm值沒什麼用的,你要注意的是退火溫度,比如這是我做16S rDNA的程式,1)95度 10min(這個一般用94-95度,使DNA完全分開,這步一般固定)2)95度 30秒(94度、95度都可以,這步幾乎也是固定的)3)退火溫度 30-60秒(退火溫度你設計引物時會有告訴你的,要是是大片段,將程式建議的退火溫度減去5度,小片度就可以按照它給的溫度,注意,退火溫度是PCR的關鍵,所以一般需要摸索條件的)4)72度 延伸時間(這步固定,延伸時間與你P的片段大小和你的Taq酶有關,一般是1-2kb/min,也就是說你做1kb大小的片段就用30-60秒,依次類推)步驟2-4迴圈30次5)72度 5-10min6)15度 10min(此步可有可無)希望可以幫到你!! Tm值在你設計引物的時候才會有用,引物的Tm值一般控制在55-60度, 儘可能保證上下游引物的Tm值一致,一般不超過2度. 如果引物中的G+C含量相對偏低,則可以使引物長度稍長,而保證一定的退火溫度.不知道你懂了沒? 當然,我引物Tm值差5度的也有,照樣P的很好,呵呵。