《大宋少年志》講述了北宋慶曆年間的歷史，貌似安定繁華的景象下卻是暗流湧動，其邊境的割據政權對皇權虎視眈眈，想方設法窺探大宋機密。對於這種情況，皇帝為了維護百姓穩定生活，透過秘閣培養了少年暗探，元仲辛就是其中一位成員。

每位暗探都是經過層層考驗選拔出來的，除了元仲辛，還有趙簡、小景、王寬、薛映和韋衙內五位少年，他們性格迥異，天賦異稟，身懷絕技，不過有的是自願加入秘閣，有的則是被迫，不管怎樣，六位少年暗探齊聚秘閣，這也是種緣分，六人組成了秘閣第七齋。

元仲辛是元家庶子，精通江湖把戲，擅長旁門左道，這些伎倆雖然上不了檯面，卻能在爾虞我詐中化險為夷，逃出生天，所以元仲辛成了暗探任務的組織者，他的做法往往能出奇制勝，當初因為不連累家族而加入秘閣，這才開啟了一段傳奇經歷。

元仲辛帶領暗探小組完成了不少艱難危險的任務，保護了百姓的安定，同時他在這個過程中收穫了友情和愛情。

元仲辛最後和美麗機智的趙簡在一起了，趙簡是名叛逆少女，聰慧勇敢，美貌無雙，她為了證明女子也可保家衛國而加入秘閣，認識了元仲辛一群小夥伴，並與元仲辛日久生情，他們兩人在性格方面還是有共同之處的，都不願受束縛，渴望得到別人的認可，最重要的是都有顆赤子之心。