蛋白質是一種複雜的有機大分子的組合，含有碳、氫、氧、氮，通常還有硫，磷。蛋白質是生命最基本的組成部分之一，是生物化學的主要研究物件之一。　　蛋白質的分子結構可劃分為四級：一級結構：組成多肽鏈的線性氨基酸序列。二級結構：依靠不同肽鍵的C=O和N-H基團間的氫鍵形成的穩定結構。三級結構：由一條多肽鏈的不同氨基酸側鏈間的相互作用形成的穩定結構。四級結構：由不同多肽鏈亞基間相互作用形成具有功能的蛋白質分子。一級結構依靠轉錄過程中形成的共價鍵維持。透過蛋白質摺疊形成高一級結構。特定的多肽鏈可能有多於一個的穩定構型，每種構型都有自己特定的生物活性，其中只有一種具有天然活性。如果一個蛋白質某個區域具有二級結構，通常是α螺旋或β摺疊。隨機的區域被稱為隨機捲曲。多肽鏈進一步摺疊成更大的三維結構，依靠氫鍵，疏水作用或二硫鍵結合。蛋白質通常是很大的分子，分子量可能達到3000kDa。這麼長的氨基酸鏈通常被認為是蛋白質，短一些的氨基酸鏈被成為“多肽”，“肽”或很稀有的“寡肽”。分界線並不確定，多肽通常很少有三級結構，通常行使激素的功能而不是酶或結構單元的功能。